Biodiversité des microorganismes pathogènes et symbiotiques des plantes

Informations

Langue d'enseignement : Français
Crédits ECTS: 6

Programme

  • Heures d'enseignement dispensées à l'étudiant : 48 heures
  • Temps de travail personnel : 112 heures

Objectifs et compétences

Objectifs :
L'objectif de l'UE est de présenter les grands groupes de microorganismes (virus, bactéries et

champignons) en interaction délétère (organismes phytopathogènes) ou symbiotique avec les plantes.

L'enseignement s'attachera à montrer les structures cellulaires et les stratégies développées par les

microorganismes (adaptation de leur cycle biologique) pour permettre ces interactions. L'enseignement

basé sur des cours magistraux, des études de cas (résultant de l'analyse de publications lors des séances

de TD) et des TP montrant les techniques de mise en évidence, et de caractérisation moléculaire

de ces microorganismes. A l'issu de cet enseignement, les étudiants seront capables de comprendre les

stratégies mises en oeuvre par les microorganismes pour interagir avec les plantes et comment ces

connaissances permettent d'élaborer des stratégies innovantes de lutte (dans le cas des phytopathogènes)

ou d'utilisation de ces microorganismes (dans le cas des organismes symbiotiques).

Compétences :
  • Mettre en œuvre une démarche expérimentale scientifique permettant l'intégration dans une équipe de recherche et /ou développement.
  • Respecter l’éthique scientifique en toutes circonstances, sur la base des principes déontologiques développés traditionnellement dans le cadre universitaire.

  • Rédiger clairement et de préparer des supports de communication en utilisant diverses techniques (rapport, diaporama, note de synthèse, poster, article…), et les commenter pour un public, averti ou non, en français ou en anglais.

  • Maitriser les bases du diagnostic et de la caractérisation (en particulier moléculaire) des micro-organismes phytopathogènes
  • Manipuler des organismes phytopathogènes variés (champignons, bactéries, virus), mettre en place et suivre des expérimentations impliquant ces types de microorganismes et étudier leurs interactions avec les plantes hôtes
  • Gestion des organismes végétaux et des microorganismes dans le respect des règles de confinement en laboratoire et en serre et prendre en compte du cadre réglementaire établi pour les expérimentations réalisées sur des OGM et ou des organismes de quarantaine affectant les plantes

Organisation pédagogique

le mode de fonctionnement de l'UE est présenté au début des enseignements

Contrôle des connaissances

session 1:

Examen écrit terminal sous forme d'une épreuve écrite de synthèse (3h) - coef. 0,6

contrôle continu (épreuve orale) et compte-rendu de TP - coef. 0,4

note éliminatoire à 8/20

session 2:

Examen écrit terminal sous forme d'une épreuve écrite de synthèse (3h) - coef. 0,6

report de la note de contrôle continu (épreuve orale) et de compte-rendu de TP - coef. 0,4

note éliminatoire à 8/20

Lectures recommandées

l'ensemble des références bibliographiques est communiqué au début des enseignements

Responsable de l'unité d'enseignement

Gerard Barroso

Enseignants

la composition de l'ensemble de l'équipe pédagogique est communiquée au début des enseignements