Omiques et BioInformatique

Informations

Langue d'enseignement : Anglais
Crédits ECTS: 6

Programme

  • Heures d'enseignement dispensées à l'étudiant : 50 heures
  • Temps de travail personnel : 130 heures

Objectifs et compétences

Objectifs :
- Aborder le cœur de métier de la bioinformatique (fouille de données dans les banques de données, alignement de séquences, phylogénie) et de la production des données "omiques" (génome, transcriptome, protéome) à travers une initiation à l'algorithmique et à l'utilisation de suites bioinformatiques comme EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite).

- Il est prévu de proposer 3 ECTS pour la partie bioinformatique à la formation continue sous forme de stage.

Compétences :
  • Travailler en réseau, utiliser les outils numériques de communication et de travail collaboratif.
  • Être responsable, à l'ère du numérique, de la maîtrise de son identité numérique, respecter la réglementation en matière de vie privée et de propriété intellectuelle.
  • Travailler en équipe dans différents contextes, y compris avec des personnes issues de disciplines différentes : s'intégrer, se positionner, collaborer, communiquer et rendre compte.

  • Lire et comprendre, dans sa globalité, un document scientifique et technique dans une langue étrangère
  • Développer une argumentation avec un esprit critique
  • Savoir mettre en œuvre une méthodologie: choisir la meilleure stratégie, construire un protocole analytique, identifier les sources d’erreur, analyser et interpréter les données.

  • Comprendre les principes, bénéfices et limites de la modélisation informatique en biologie
  • Connaître les principes de base de l'algorithmique

  • Se servir aisément de la compréhension de l’écrit et de l’oral en anglais

Organisation pédagogique

le mode de fonctionnement de l'UE est présenté au début des enseignements

Contrôle des connaissances

Session 1:

Examen écrit, 1h30, Coeff. 0.6

Contrôle continu, Coeff. 0.4

Session 2:

Examen écrit ou oral selon effectif, 1h30, Coeff. 1.0

Lectures recommandées

l'ensemble des références bibliographiques est communiqué au début des enseignements

Responsable de l'unité d'enseignement

Jean-Christophe Taveau

Enseignants

la composition de l'ensemble de l'équipe pédagogique est communiquée au début des enseignements