Initiation à l'exploration d'images numériques

Informations

Langue d'enseignement : Anglais
Crédits ECTS: 6

Programme

  • Heures d'enseignement dispensées à l'étudiant : 50 heures
  • Temps de travail personnel : 100 heures

Objectifs et compétences

Objectifs :
- Initiation aux principaux concepts de traitement et d'analyse d'images numériques biologiques

- Applications au logiciel ImageJ et initiation à l'automatisation de fonctions avec JavaScript

- Initiation aux technologies du web HTML5, CSS3 et JavaScript.

- Il est prévu de proposer 3 ECTS pour la partie sur l'initiation à l'imagerie et à ImageJ à la formation continue sous forme de stage.

Compétences :
  • Travailler en réseau, utiliser les outils numériques de communication et de travail collaboratif.
  • Travailler en équipe dans différents contextes, y compris avec des personnes issues de disciplines différentes : s'intégrer, se positionner, collaborer, communiquer et rendre compte.

  • Développer une argumentation avec un esprit critique
  • Savoir mettre en œuvre une méthodologie: choisir la meilleure stratégie, construire un protocole analytique, identifier les sources d’erreur, analyser et interpréter les données.

  • Maîtriser un ou plusieurs langages de programmation pour l'appliquer aux domaines des sciences du vivant (statistiques, bases de données, imagerie, modélisation).
  • Utiliser des logiciels d’acquisition, de visualisation et d’analyse de données propres au domaine

  • Utiliser une bibliothèque (API) en consultant sa documentation technique
  • Savoir traiter l’information en anglais quelle que soit la nature du support (vidéo, audio, écrit, représentation graphique…)

Organisation pédagogique

le mode de fonctionnement de l'UE est présenté au début des enseignements

Contrôle des connaissances

Session 1:

Examen écrit, 1h30, Coeff. 0.6

Contrôle continu, Coeff. 0.4

Session 2:

Examen écrit ou oral selon effectif, 1h30, Coeff. 1.0

Lectures recommandées

l'ensemble des références bibliographiques est communiqué au début des enseignements

Responsable de l'unité d'enseignement

Jean-Christophe Taveau

Enseignants

la composition de l'ensemble de l'équipe pédagogique est communiquée au début des enseignements